příspěvková organizace Ministerstva kultury
Založeno v roce 1898, sídlí v historických budovách opevnění města.
Expozice:
- Na jevišti světa. Jan Amos Komenský a jeho doba
- Uherský Brod v proměnách času
- Starožitnosti Uherskobrodska
- Rolnický dům a hospodářství čp. 57 v obci Vlčnov
Muzeum připravuje krátkodobé výstavy a kulturní akce.
Sbírky muzea:
- archeologie, historie, etnografie, umění regionu, numizmatika, Komenský v umění, staré tisky a umělecká knižní vazba.
V muzeu je odborná knihovna, archiv, fotografický archiv a archiv audiovizuálních záznamů.
Vydává mezinárodní odborný časopis Studia Comeniana et historica a pořádá mezinárodní komeniologická kolokvia.
Pořádá rovněž Musaionfilm – přehlídku videofilmů s muzejní tematikou.
Od r. 2022 muzeum provozuje Muzejní centrum digitalizace audiovizuálních záznamů.
Muzeum spolupracuje s Comenius museum v Naardenu v Nizozemsku. Vytvořilo pro něj expozici Mundus Comenii (Svět Komenského).